Stránky

Zavádzanie senzora


Aby som doplnil veľmi stručný prehľad systému Guardian REAL-Time, ktorého niektoré súčasti som spomenul a ukázal minule, pripájam video. Video vysvetľuje zavádzanie senzora Enlite a zároveň ponúka pohľad na ostatné (v podstate všetky ostatné) súčasti CGM systému Guardian REAL-Time okrem monitora.



Podobných videí ja samozrejme veľa. Toto konkrétne sa mi páčilo najviac z tých čo som si pozrel a presne takto som postupoval aj ja sám. Ak by som mal odporučiť nejaké ďalšie videá, tak tieto:
Na záver, infúzna sada inzulínovej pumpy a Enlite senzor spolu v jednom videu.

MT

15. 3. 2014

CGM nediabetika


Nedávno som mal možnosť vyskúšať CGM na vlastnej koži. Doslova. CGM je skratka pre Continuous Glucose Monitoring, teda systém pre kontinuálne monitorovanie glykémie. V tomto prípade je reč o CGM od spoločnosti Medtronic. Systém sa nazýva Guardian REAL-Time. Na fotke vyššie je takzvaný monitor tohto systému.

V prvom rade som chcel vedieť aké to je používať CGM. Zároveň to bola príležitosť získať dáta technicky rovnaké ako predmetné dáta projektu DiaDAQ s tým rozdielom, že v tomto prípade ide o „nediabetický denník.“ Najväčšou výhodou takto získaných dát je, že presne poznám okolnosti, pri ktorých boli získané čo umožní lepšie porozumieť výsledkom meraní a lepšie pripraviť spracovanie dát aj z iných zdrojov.


CareLink

Nediabetický denník obsahuje hodnoty glykémie namerané pomocou klasického glukomera (konkrétne ten čo je na obrázku vyššie), záznamy o príjme sacharidov a priebeh glykémie nameraný pomocou CGM. Všetky tieto dáta sa dajú do istej miery spracovať pomocou softvéru, ktorý poskytuje výrobca CGM zadarmo. Je to vlastne služba poskytovaná cez internet. Nazýva sa CareLink Personal. Dáta z CGM monitora, z glukomera a iné zaznamenané v Denníku je možné jednoducho odovzdať a následne prehľadne zobraziť vo forme rôznych správ.

Glukomer používaný v tomto prípade nie je kompatibilný s CareLink-om. Údaje o sacharidoch a navyše aj hodnoty glykémie z glukomera je preto potrebné zadať manuálne. CGM monitor umožňuje zaznamenať udalosti vtedy keď sú aktuálne. Udalosťou môže byť meranie glykémie glukomerom, príjem sacharidov či iné. Záznamy sa potom z monitora prenesú do CareLinku. Sacharidy a iné udalosti je možné zapísať do Denníka v CareLinku aj spätne v čase. Údaje z glukomera však nie je možné zadávať priamo do CareLinku. Ak neboli priebežne zaznamenávané v monitore a nie je ich možné priamo stiahnuť z glukomera (ako v tomto prípade) do CareLunk-u sa nedostanú. Výnimkou sú samozrejme tzv. kalibračné glykémie senzora, teda hodnoty, ktoré by mali byť namerané glokomerom a slúžia ako kalibrácia CGM.

Mimochodom, dovolím si dúfať, že pri bežnom používaní CGM je počet meraní glukomerom vyšší ako počet kalibračných glykémií.

Osobne som údaje o sacharidoch a údaje z glukomera zaznamenával jednoducho pomocou tabuliek na Google disk (alebo pomocou excelovskej tabuľky) a až neskôr som sacharidy pre zaujímavosť zadal aj do CareLink-u.

Príklad denného sumáru vygenerovaného pomocou softvéru CareLink je na nasledujúcom obrázku:
Obr. 1: Denný sumár

Najdôležitejšie však je, že CareLink umožňuje vygenerovať dátový súbor (konkrétne obyčajný csv súbor), ktorý obsahuje všetky možné dáta zaznamenané v monitore. To umožní napríklad zobraziť tie isté údaje ako v uvedenom dennom sumári a ešte oveľa viac.

Zobrazenie dát

Pozorný čitateľ si všimne, že na Obr. 1 rozsahy y-osí v grafoch nie sú zvolené pre tento prípad práve výhodne. V CareLink-u to nie je možné zmeniť. Pre cieľovú skupinu to asi ani nie je potrebné. Avšak pri vlastnom spracovaní dát je samozrejme možné spraviť všetko po svojom...

Senzor som zaviedol v nedeľu večer, približne o 18:30. V monitore bol senzor odštartovaný o 18:37. Všetko fungovalo podľa očakávania. Po dvoj hodinovom warm-up senzora v čase 20:37 ma systém vyzval zadať prvú kalibračnú glykémiu. V čase 20:56 sa zobrazila prvá hodnota glykémie nameraná pomocou CGM. Zaspával som zmierený s tým, že na ďalšiu kalibráciu budem vyzvaný o 6 hodín od prvej kalibrácie, teda niekedy pred treťou hodinou ráno (nastavil som si budík).

O 02:17 ma však zobudilo varovanie senzora: hypo. Ako prvé som zistil, že je to vlastne už druhé varovanie senzora. O 02:11 bolo totiž varovanie senzora: predpokladaná hypo, ktoré ma nezobudilo :) Ako druhé som zistil, že nie som schopný o druhej ráno zistiť čo sa s CGM vlastne deje. Keď už som bol zobudený, tak som rovno zadal ďalšiu kalibračnú glykémiu, vypol zvukové výstrahy alarmov a išiel spať ďalej.

Ráno som zistil, že CGM hlási asi milión alarmov a ukazuje glykémiu nižšiu ako 2,2 mmol/l , čo zjavne nebola pravda inak by som sa asi nezobudil. Ešte raz som systém nakalibroval o 06:13 a o 07:37. V pondelok doobeda som nemal čas venovať sa svojmu CGM a až po obede sa mi konečne začalo dariť merať niečo zmysluplné. Dáta vyzerajú nasledovne:

Obr. 2: Pondelok

Nasledujúce tri dni sa mi darilo celkom dobre. Aspoň na prvý pohľad. Dáta sú nasledovné:

Obr. 3: Utorok
Obr. 4: Streda
Obr. 5: Štvrtok

Piatkové dáta sú mierne odlišné oproti predchádzajúcim dňom. Sú akosi viac kmitavé:

Obr. 6: Piatok

Opäť, pozorný čitateľ si všimne náhle skoky v meranom priebehu glykémie, napr. 18.02. po 09:00, alebo medzeru v dátach v stredu v noci. Všetky tieto nejasnosti sú a budú predmetom ďalšieho „výskumu“ s cieľom lepšie porozumieť danému CGM a mať tak z neho väčší úžitok.

MT

14. 3. 2014

Predmetné dáta

Predmetom projektu DiaDAQ sú dáta bežne používané pri self-monitoringu diabetu 1. typu. Klasický diabetický denník je základným zdrojom takýchto dát. Obsahuje namerané hodnoty glykémie, záznamy o príjme sacharidov a samozrejme záznamy o dávkach inzulínu. Doplňujúcimi sú údaje o fyzickej aktivite, športovaní a o iných okolnostiach významne ovplyvňujúcich glykémiu.

Základom je meranie glykémie pomocou glukomera a záznamy o množstve sacharidových jednotiek (SJ). Záznamy počas jedného dňa môžu vyzerať nasledovne:
Glykémia bola odmeraná bežným glukomerom len tri krát za 24 hodín. To je relatívne nízky počet meraní, ktorý nezodpovedá ani malému glykemickému profilu. Pre potreby projektu je potrebný počet meraní aspoň v rozsahu veľkého glykemického profilu, teda sedem a viac meraní za deň.

K uvedeným dátam patria ešte záznamy o inzulíne. V tomto prípade bol inzulín podávaný pomocou inzulínovej pumpy. Z pohľadu získavania dát je to výhodné pretože pumpa zaznamenáva údaje o inzulíne automaticky a ľahko ich možno uložiť v elektronickej forme tak aby sa s nimi dalo ďalej pracovať. Záznamy o inzulíne vyzerajú nasledovne:
Ak by bolo v uvedenom príklade viac meraní glykémie (ťažko povedať koľko, dovolíme si predpokladať, že diabetik vie kedy odmerať glykémiu tak aby bol vystihnutý podstatný charakter priebehu glykémie), predstavovali by tieto dáta akési minimum, o ktoré je záujem v projekte DiaDAQ.

Údaje o sacharidoch je možné doplniť o informáciu o type jedla z pohľadu rýchlosti vstrebávania glukózy po jedle. Napríklad k množstvu sacharidov sa pridá poznámka „rýchle sacharidy“ čo znamená jedlo s vyšším glykemickým indexom.

Ak by inzulín nebol podávaný pumpou, záznamy o inzulíne by boli mierne odlišné. Bolusov by bolo zrejme menej. Bazálny inzulín by nebol zaznamenaný ako rýchlosť podávania v jednotkách inzulínu za hodinu, ale rovnako ako bolus, teda dávka v inzulínových jednotkách v danom čase. K tomu všetkému ešte patrí informácia o druhu či type inzulínu. Pumpa používa stále len jeden typ.

Dávkovanie bolusov v uvedenom príklade prezrádza, že v tomto prípade muselo byť k dispozícii viac informácií o priebehu glykémie ako len tri merania za deň. Uvedené merania sú totiž len kalibráciou pre kontinuálne monitorovanie glykémie.

Systém pre kontinuálne monitorovanie glykémie poskytuje informáciu o glykémii každých päť minút. Údaje sa zaznamenávajú automaticky a vďaka obslužnému softvéru sú ľahko dostupné pre ďalšie spracovanie. Priebeh glykémie zaznamenaný pomocou CGM (Continuous Glucose Monitoring) vyzerá nasledovne:


Je zrejmé, že CGM umožňuje výrazne zvýšiť kvalitu self-monitoringu oproti klasickému diabetickému denníku. CGM je preto základom pre výhodnejší variant získavania predmetných dát.

Cieľom projektu DiaDAQ je vlastne získať veľmi kvalitný diabetický denník a spracovať tieto dáta tak aby boli využiteľné pre aplikácie Biokybernetiky v oblasti kompenzácie diabetu.

Poznámočka k využitiu predmetných dát

Príkladom využitia predmetných dát z pohľadu Kybernetiky (alebo Biokybernetiky ak chcete) môže byť takzvaná krátkodobá predikcia glykémie. Inými slovami predpoveď vývoja glykémie na povedzme pol hodinu dopredu. Slúžiť to môže napríklad pre včasný alarm hypoglykémie.

Glykémia sa dá predikovať pomocou matematického modelu predikcie. Aj počasie sa dá predikovať, teda predpovedať, pomocou matematického modelu. Princíp je pritom zhruba rovnaký. Príkladom modelu pre počasie je model ALADIN, ktorý používa SHMÚ.

Základom pre návrh takého modelu predikcie sú dáta a ďalších milión detailov. Výsledkom dosiahnutým pre dáta uvedené vyššie môže byť napríklad niečo takéto:
Predikuje sa vývoj glykémie na 40 minút dopredu. Kvalita predikcie sa dá zhruba posúdiť pomocou nasledujúceho obrázku. Farebné označenie je rovnaké ako na predchádzajúcom obrázku.
Červená čiara predstavuje glykémiu predikovanú na 40 minút dopredu. Posudzovanie kvality predikcie, jej zlepšovanie (napr. predĺženie času, pre ktorý je možné predikovať), to všetko a ešte o veľa viac je predmetom výskumu, ktorého základom sú predmetné dáta.

1. 2. 2014